Итогом многолетней деятельности университета является подготовка более 40 тысяч врачей. Среди выпускников более 350 докторов, 1600 кандидатов медицинских и биологических наук. Воспитанники работают во всех регионах страны, а также в странах СНГ и дальнего зарубежья. Безусловным достижением ОмГМУ является целевой набор, который составляет 45,4 % от общего количества студентов, обучающихся на бюджетной основе. Сегодня заключены договоры о подготовке врачей с администрациями и органами здравоохранения Омской, Курганской, Томской, Новосибирской областей, ХМАО, Красноярского и Алтайского краёв и других регионов. Ежегодно вуз выпускает более 10 тысяч врачей.